Arheološka zbirka Muzeja formirana je početkom šezdesetih godina XX vijeka, a njeni počeci vezuju se za skroman , ali značajan fundus od svega jedanaest predmeta .Od tog broja, deset predmeta darovala je Uprava rudnika “ Brskovo “ iz Mojkovca. Riječ je o predmetima i opremi korišćenim u rudarskoj djelatnosti, koji danas svjdoče o jednom važnom istorijskom periodu i pružaju dragocjen uvid u život i rad srednjovjekovnih rudarskih naselja i gradova.
Rudnik Brskovo osnovali su njemački rudari Sasi u XIII vijeku. U istorijskim izvorima Brskovo se pominje kao značajno privredno središte i razvijeno rudarsko naselje koje je, u vrijeme najvećeg procvata, preraslo u manji grad sa razvijenim trgovačkim životom. O značaju Brskova svjedoči i primjerak srebrnog novca iz njegove kovanice, koji se čuva u numizmatičkoj zbirci Muzeja.
Od svojih skromnih početaka do danas, arheološka zbirka izrasla je u jednu od najznačajnijih i najreprezentativnijih muzejskih zbirki. Njen fond danas čini veliki broj predmeta, najvećim dijelom prikupljenih tokom arheoloških istraživanja i iskopavanja , dok manji dio potiče iz slučajnih nalaza, poklona i otkupa.
Prva stručna arheološka istraživanja na području bjelopoljske opštine sprovedena su u selu Bijedići, na lokalitetu „Trnje“. Od kraja sedamdesetih godina XX vijeka istraživanja se intenziviraju i obuhvataju veći broj lokaliteta, čime je valorizovan značajan fond kulturnih dobara – od lokalnog do međunarodnog značaja.
Arheološku zbirku danas čine predmeti koji svjedoče o kontinuitetu života na ovom prostoru kroz tri velike istorijske epohe : praistoriju, antiku i srednji vijek. Kao svojevrsni čuvar materijalnih tragova prošlosti , zbirka pruža dragocjen uvid u razvoj kultura, naselja i načina života na području Bijelog Polja i šireh prostora Crne Gore.
Praistorijski period
Praistorijske nalaze čini bogat materijal prikupljen na lokalitetima u bjelopoljskom kraju, koji svjedoči o ranim oblicima života. Najstariji tragovi datuju iz neolita (oko 4000–2300. godine p.n.e.) i bronzanog doba (2000–1000. godine p.n.e.). U stalnoj postavci Muzeja zastupljeni su nalazi sa lokaliteta Trnje (Bijedići), Samograd, Majstorovina, Voljavac i Ostrelj.
Antički period
Antički materijal potiče sa lokaliteta Lim (Bijelo Polje), Majstorovina i Podgajnice (Zaton). Ovi nalazi svjedoče o prisustvu i kontaktima antičkih kultura u dolini Lima.
Srednji vijek
Srednjovjekovni period je najobimnije istražen, pa predmeti iz ovog doba zauzimaju centralno mjesto u stalnoj postavci. Najznačajniji lokaliteti su: crkva sv. Petra i Pavla (Bijelo Polje), crkva sv. Nikole (Nikoljac), crkva Presvete Bogorodice (Voljavac), Brskovo (Mojkovac), kao i nalazi sa Ribarevina, Nedakusa, Boljara i drugih lokaliteta.